I docenti del Dipartimento afferiscono ai seguenti corsi di dottorato:
- Dottorato in Fisiopatologia Clinica
- Dottorato regionale in Biochemistry and Molecular Biology – Bibim 2.0 (progetto Pegaso; consorzio tra Università di Siena, Firenze e Pisa; sede amministrativa Università di Siena)
- Elenco completo dei Corsi di Dottorato di Ricerca delle Scienze mediche, farmaceutiche e veterinarie dell’Università di Pisa